Naruto bị mọi người xa lánh vì cậu mang trong mình Cửu Vĩ Hồ Ly – con quái vật từng tàn phá Làng Lá.Cậu luôn cố gắng chứng tỏ bản thân, tham gia đội 7 cùng Sasuke Uchiha và Sakura Haruno, dưới sự hướng dẫn của Hatake Kakashi.Trải qua nhiều cuộc chiến, Naruto dần mạnh hơn, đối đầu với các thế lực như Orochimaru, Akatsuki và bảo vệ bạn bè.Sasuke rời làng để tìm sức mạnh trả thù anh trai Itachi, khiến Naruto quyết tâm đưa cậu ấy trở về
Naruto trở về sau 2 năm luyện tập với Jiraiya và bước vào cuộc chiến chống lại Akatsuki, tổ chức săn lùng Vĩ Thú.Cậu khám phá sự thật về Cửu Vĩ, số phận của mình và bí mật về cha mẹ.Cuộc đại chiến ninja lần thứ tư nổ ra do Madara Uchiha và Obito Uchiha khởi xướng.Naruto trở thành người lãnh đạo quan trọng, cùng Sasuke hợp tác đánh bại Kaguya Otsutsuki – trùm cuối của cuộc chiến.Trận chiến cuối cùng giữa Naruto và Sasuke diễn ra, kết thúc bằng hòa giải và Sasuke quay về làng.
Naruto Next Generations kể về Boruto Uzumaki, con trai của Hokage Đệ Thất Naruto, người luôn tìm cách thoát khỏi cái bóng của cha mình. Cậu cùng bạn bè như Sarada Uchiha và Mitsuki trải qua nhiều thử thách, đối đầu với tổ chức Kara và tộc Otsutsuki. Sau khi nhận Ấn Karma từ Momoshiki Otsutsuki, Boruto dần bị biến đổi, trong khi Naruto mất Kurama và bị phong ấn. Kawaki thao túng thực tại, khiến Boruto bị xem là kẻ phản bội. Ba năm sau, Boruto quay lại, mạnh mẽ hơn, quyết tâm lấy lại tất cả và đối mặt với số phận của mình.
