Naruto sinh ra là con trai của Hokage Đệ Tứ Minato Namikaze và Kushina Uzumaki. Ngay khi mới chào đời, cậu bị phong ấn Cửu Vĩ Hồ Ly (Kurama) vào cơ thể sau khi cha mẹ hy sinh để bảo vệ làng Lá. Vì điều này, Naruto bị dân làng xa lánh và sống cô độc từ nhỏ.
Naruto được phân vào Đội 7 cùng Sasuke Uchiha và Sakura Haruno, dưới sự dẫn dắt của Kakashi Hatake. Cậu trải qua nhiều nhiệm vụ nguy hiểm như đối đầu với Zabuza, tham gia kỳ thi Chunin và gặp Orochimaru. Khi Sasuke rời làng để tìm sức mạnh, Naruto quyết tâm đưa bạn trở về.
Naruto rời làng để tập luyện cùng Jiraiya trong 2 năm rưỡi. Trở về, cậu trở thành một ninja mạnh mẽ, đối đầu với tổ chức Akatsuki và bảo vệ bạn bè. Cậu học được Hiền Nhân Thuật và hoàn thiện Rasenshuriken.
Naruto trở thành chìa khóa trong cuộc chiến chống lại Obito Uchiha, Madara Uchiha và Kaguya Otsutsuki. Cậu giải phóng sức mạnh của Kurama, trở thành "Con của Lời tiên tri" và cùng Sasuke đánh bại Kaguya. Cuối cùng, cậu và Sasuke quyết chiến lần cuối tại Thung lũng Tận Cùng, kết thúc mâu thuẫn giữa hai người.
Sau chiến tranh, Naruto kết hôn với Hinata Hyuga và có hai con: Boruto và Himawari. Cậu trở thành Hokage Đệ Thất, bảo vệ làng và hòa bình thế giới. Trong Boruto: Naruto Next Generations, Naruto tiếp tục đấu tranh để bảo vệ gia đình và thế giới ninja khỏi những mối đe dọa mới như Otsutsuki.Naruto từ một đứa trẻ bị ghét bỏ đã trở thành người hùng vĩ đại của thế giới shinobi.